Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Prkaa1Q5EG47 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms