Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
C87499Q3UX49 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms