Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lmod2Q3UHZ5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lmod2Q3UHZ5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lmod2Q3UHZ5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lmod2Q3UHZ5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Lmod2Q3UHZ5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lmod2Q3UHZ5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lmod2Q3UHZ5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lmod2Q3UHZ5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Lmod2Q3UHZ5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lmod2Q3UHZ5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lmod2Q3UHZ5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms