Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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