Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms