Protein–RNA interactions for Protein: P70188

Kifap3, Kinesin-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifap3P70188 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kifap3P70188 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kifap3P70188 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kifap3P70188 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kifap3P70188 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kifap3P70188 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kifap3P70188 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kifap3P70188 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kifap3P70188 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kifap3P70188 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kifap3P70188 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kifap3P70188 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kifap3P70188 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kifap3P70188 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Kifap3P70188 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kifap3P70188 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kifap3P70188 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kifap3P70188 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kifap3P70188 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kifap3P70188 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kifap3P70188 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kifap3P70188 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kifap3P70188 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kifap3P70188 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kifap3P70188 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kifap3P70188 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kifap3P70188 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kifap3P70188 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kifap3P70188 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kifap3P70188 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kifap3P70188 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kifap3P70188 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kifap3P70188 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kifap3P70188 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kifap3P70188 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kifap3P70188 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kifap3P70188 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kifap3P70188 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kifap3P70188 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Kifap3P70188 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kifap3P70188 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kifap3P70188 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kifap3P70188 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kifap3P70188 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kifap3P70188 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kifap3P70188 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kifap3P70188 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms