Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa11P50709 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa11P50709 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa11P50709 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa11P50709 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa11P50709 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa11P50709 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa11P50709 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms