Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nedd4P46935 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nedd4P46935 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms