Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cnga1P29974 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms