Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd8P23463 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd8P23463 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms