Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lama1P19137 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama1P19137 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama1P19137 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama1P19137 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lama1P19137 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lama1P19137 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lama1P19137 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lama1P19137 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 325.1 ms