Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR5

Tdpoz1, TD and POZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdpoz1P0DMR5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tdpoz1P0DMR5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tdpoz1P0DMR5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms