Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxb3P09026 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb3P09026 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms