Protein–RNA interactions for Protein: P06325

Tcrg-V1, T-cell receptor gamma chain V region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-V1P06325 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcrg-V1P06325 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcrg-V1P06325 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms