Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01725 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01725 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01725 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01725 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01725 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01725 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01725 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01725 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01725 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01725 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01725 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01725 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01725 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01725 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01725 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01725 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01725 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01725 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01725 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01725 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01725 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01725 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01725 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01725 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01725 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01725 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01725 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01725 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01725 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01725 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01725 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01725 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01725 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01725 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01725 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01725 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01725 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01725 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01725 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01725 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01725 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01725 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01725 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01725 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01725 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01725 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01725 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01725 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01725 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01725 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01725 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01725 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01725 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01725 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01725 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01725 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01725 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01725 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01725 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01725 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01725 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01725 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01725 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01725 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01725 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01725 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01725 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01725 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01725 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01725 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01725 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01725 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01725 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01725 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01725 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01725 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01725 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01725 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01725 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01725 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01725 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01725 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01725 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01725 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01725 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01725 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01725 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01725 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01725 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01725 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01725 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01725 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01725 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01725 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01725 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01725 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01725 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01725 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01725 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms