Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Parp2O88554 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Parp2O88554 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Parp2O88554 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Parp2O88554 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Parp2O88554 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Parp2O88554 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Parp2O88554 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Parp2O88554 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Parp2O88554 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms