Protein–RNA interactions for Protein: O55233

Cer1, Cerberus, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cer1O55233 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cer1O55233 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cer1O55233 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cer1O55233 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cer1O55233 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cer1O55233 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cer1O55233 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cer1O55233 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cer1O55233 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cer1O55233 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cer1O55233 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cer1O55233 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cer1O55233 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cer1O55233 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cer1O55233 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cer1O55233 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cer1O55233 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cer1O55233 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cer1O55233 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cer1O55233 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cer1O55233 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cer1O55233 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cer1O55233 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cer1O55233 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cer1O55233 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cer1O55233 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cer1O55233 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms