Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-ObO35424 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms