Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad7O35253 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad7O35253 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad7O35253 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad7O35253 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad7O35253 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smad7O35253 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms