Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IfnabL7MTU6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IfnabL7MTU6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IfnabL7MTU6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IfnabL7MTU6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IfnabL7MTU6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IfnabL7MTU6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IfnabL7MTU6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IfnabL7MTU6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IfnabL7MTU6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IfnabL7MTU6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IfnabL7MTU6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IfnabL7MTU6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IfnabL7MTU6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IfnabL7MTU6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IfnabL7MTU6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IfnabL7MTU6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IfnabL7MTU6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IfnabL7MTU6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IfnabL7MTU6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IfnabL7MTU6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IfnabL7MTU6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IfnabL7MTU6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IfnabL7MTU6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IfnabL7MTU6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IfnabL7MTU6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IfnabL7MTU6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms