Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms