Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC31.07■■■□□ 2.57
Nup160Q9Z0W3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Nup160Q9Z0W3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Nup160Q9Z0W3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms