Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.3■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Plxnb3Q9QY40 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Plxnb3Q9QY40 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms