Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lsm4Q9QXA5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms