Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
AatfQ9JKX4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AatfQ9JKX4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms