Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bco1Q9JJS6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bco1Q9JJS6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bco1Q9JJS6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bco1Q9JJS6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bco1Q9JJS6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bco1Q9JJS6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Bco1Q9JJS6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bco1Q9JJS6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bco1Q9JJS6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bco1Q9JJS6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Bco1Q9JJS6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Bco1Q9JJS6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bco1Q9JJS6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Bco1Q9JJS6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Bco1Q9JJS6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Bco1Q9JJS6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Bco1Q9JJS6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Bco1Q9JJS6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Bco1Q9JJS6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Bco1Q9JJS6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Bco1Q9JJS6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Bco1Q9JJS6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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