Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph3bQ9DA80 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms