Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zcchc8Q9CYA6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zcchc8Q9CYA6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms