Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH2

Pard3, Partitioning defective 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3Q99NH2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pard3Q99NH2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pard3Q99NH2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pard3Q99NH2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pard3Q99NH2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pard3Q99NH2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pard3Q99NH2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pard3Q99NH2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pard3Q99NH2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pard3Q99NH2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pard3Q99NH2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pard3Q99NH2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pard3Q99NH2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pard3Q99NH2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pard3Q99NH2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pard3Q99NH2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pard3Q99NH2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pard3Q99NH2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pard3Q99NH2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pard3Q99NH2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pard3Q99NH2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pard3Q99NH2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pard3Q99NH2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pard3Q99NH2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pard3Q99NH2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pard3Q99NH2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pard3Q99NH2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms