Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sntg1Q925E1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms