Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spdl1Q923A2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spdl1Q923A2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms