Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcl3Q8BVF2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms