Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pja2Q80U04 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms