Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zbtb40Q6PCS8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
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