Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdr44Q6NVE8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Wdr44Q6NVE8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms