Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NipblQ6KCD5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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