Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Knl1Q66JQ7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Knl1Q66JQ7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms