Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmb6Q60692 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms