Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SynrgQ5SV85 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SynrgQ5SV85 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SynrgQ5SV85 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SynrgQ5SV85 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SynrgQ5SV85 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SynrgQ5SV85 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SynrgQ5SV85 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SynrgQ5SV85 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SynrgQ5SV85 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynrgQ5SV85 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SynrgQ5SV85 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynrgQ5SV85 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SynrgQ5SV85 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynrgQ5SV85 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynrgQ5SV85 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynrgQ5SV85 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynrgQ5SV85 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynrgQ5SV85 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SynrgQ5SV85 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms