Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Psme4Q5SSW2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psme4Q5SSW2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms