Protein–RNA interactions for Protein: P54775

Psmc4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc4P54775 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc4P54775 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc4P54775 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms