Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa11P50709 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa11P50709 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa11P50709 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa11P50709 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa11P50709 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa11P50709 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms