Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmod1P49813 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms