Protein–RNA interactions for Protein: P41272

Cd27, CD27 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd27P41272 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd27P41272 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd27P41272 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd27P41272 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd27P41272 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd27P41272 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd27P41272 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd27P41272 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd27P41272 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd27P41272 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd27P41272 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd27P41272 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd27P41272 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd27P41272 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd27P41272 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd27P41272 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd27P41272 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd27P41272 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd27P41272 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd27P41272 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd27P41272 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd27P41272 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd27P41272 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd27P41272 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd27P41272 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd27P41272 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd27P41272 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd27P41272 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd27P41272 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd27P41272 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd27P41272 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd27P41272 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms