Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ly6dP35459 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms