Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rom1P32958 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rom1P32958 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rom1P32958 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rom1P32958 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rom1P32958 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rom1P32958 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rom1P32958 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rom1P32958 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rom1P32958 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rom1P32958 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rom1P32958 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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