Protein–RNA interactions for Protein: P31315

Gsx1, GS homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx1P31315 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gsx1P31315 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gsx1P31315 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms