Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tacr1P30548 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms