Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cnga1P29974 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cnga1P29974 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cnga1P29974 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms