Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prf1P10820 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prf1P10820 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prf1P10820 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prf1P10820 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prf1P10820 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prf1P10820 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prf1P10820 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prf1P10820 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prf1P10820 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prf1P10820 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms